Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB7

Clcnka, Chloride channel protein ClC-Ka, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClcnkaQ9WUB7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ClcnkaQ9WUB7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ClcnkaQ9WUB7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ClcnkaQ9WUB7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ClcnkaQ9WUB7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClcnkaQ9WUB7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ClcnkaQ9WUB7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms