Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnfsf13bQ9WU72 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnfsf13bQ9WU72 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnfsf13bQ9WU72 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tnfsf13bQ9WU72 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tnfsf13bQ9WU72 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tnfsf13bQ9WU72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tnfsf13bQ9WU72 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Tnfsf13bQ9WU72 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Tnfsf13bQ9WU72 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.2 ms