Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQM7

CAMK2A, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2AQ9UQM7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CAMK2AQ9UQM7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CAMK2AQ9UQM7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2AQ9UQM7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMK2AQ9UQM7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMK2AQ9UQM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms