Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CNTN6Q9UQ52 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNTN6Q9UQ52 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNTN6Q9UQ52 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CNTN6Q9UQ52 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CNTN6Q9UQ52 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNTN6Q9UQ52 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms