Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
THSD7AQ9UPZ6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
THSD7AQ9UPZ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
THSD7AQ9UPZ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
THSD7AQ9UPZ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
THSD7AQ9UPZ6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
THSD7AQ9UPZ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
THSD7AQ9UPZ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
THSD7AQ9UPZ6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
THSD7AQ9UPZ6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
THSD7AQ9UPZ6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
THSD7AQ9UPZ6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
THSD7AQ9UPZ6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms