Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SATB2Q9UPW6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
SATB2Q9UPW6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SATB2Q9UPW6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SATB2Q9UPW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SATB2Q9UPW6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SATB2Q9UPW6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms