Protein–RNA interactions for Protein: Q9UND3

NPIPA1, Nuclear pore complex-interacting protein family member A1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA1Q9UND3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NPIPA1Q9UND3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPIPA1Q9UND3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPIPA1Q9UND3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NPIPA1Q9UND3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NPIPA1Q9UND3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPA1Q9UND3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms