Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLEC4AQ9UMR7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLEC4AQ9UMR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLEC4AQ9UMR7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLEC4AQ9UMR7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLEC4AQ9UMR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms