Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBLCQ9ULV8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBLCQ9ULV8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBLCQ9ULV8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBLCQ9ULV8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms