Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT0

TTC7A, Tetratricopeptide repeat protein 7A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7AQ9ULT0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC7AQ9ULT0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC7AQ9ULT0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC7AQ9ULT0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TTC7AQ9ULT0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TTC7AQ9ULT0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TTC7AQ9ULT0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TTC7AQ9ULT0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
TTC7AQ9ULT0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TTC7AQ9ULT0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TTC7AQ9ULT0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TTC7AQ9ULT0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TTC7AQ9ULT0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TTC7AQ9ULT0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TTC7AQ9ULT0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms