Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF490Q9ULM2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF490Q9ULM2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF490Q9ULM2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF490Q9ULM2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF490Q9ULM2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF490Q9ULM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF490Q9ULM2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms