Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDH7Q9ULB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CDH7Q9ULB5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CDH7Q9ULB5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CDH7Q9ULB5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDH7Q9ULB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms