Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUP50Q9UKX7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP50Q9UKX7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP50Q9UKX7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NUP50Q9UKX7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms