Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO9Q9UK97 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO9Q9UK97 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FBXO9Q9UK97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FBXO9Q9UK97 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FBXO9Q9UK97 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FBXO9Q9UK97 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms