Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C3orf18Q9UK00 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C3orf18Q9UK00 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C3orf18Q9UK00 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C3orf18Q9UK00 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C3orf18Q9UK00 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms