Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXD3Q9UJU5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FOXD3Q9UJU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FOXD3Q9UJU5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXD3Q9UJU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms