Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYTH4Q9UIA0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CYTH4Q9UIA0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CYTH4Q9UIA0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CYTH4Q9UIA0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CYTH4Q9UIA0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CYTH4Q9UIA0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms