Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX20Q9UHI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX20Q9UHI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX20Q9UHI6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
DDX20Q9UHI6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
DDX20Q9UHI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
DDX20Q9UHI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DDX20Q9UHI6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms