Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ASIC3Q9UHC3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ASIC3Q9UHC3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ASIC3Q9UHC3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ASIC3Q9UHC3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ASIC3Q9UHC3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ASIC3Q9UHC3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ASIC3Q9UHC3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms