Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CGGBP1Q9UFW8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CGGBP1Q9UFW8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CGGBP1Q9UFW8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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