Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VTI1BQ9UEU0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
VTI1BQ9UEU0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
VTI1BQ9UEU0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
VTI1BQ9UEU0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VTI1BQ9UEU0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VTI1BQ9UEU0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms