Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDY6

TRIM10, Tripartite motif-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM10Q9UDY6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TRIM10Q9UDY6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
TRIM10Q9UDY6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRIM10Q9UDY6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TRIM10Q9UDY6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM10Q9UDY6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TRIM10Q9UDY6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM10Q9UDY6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 914 ms