Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUX4Q9UBX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DUX4Q9UBX2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DUX4Q9UBX2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DUX4Q9UBX2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DUX4Q9UBX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms