Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM8A1Q9UBU6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM8A1Q9UBU6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM8A1Q9UBU6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
FAM8A1Q9UBU6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM8A1Q9UBU6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FAM8A1Q9UBU6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms