Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJB9Q9UBS3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DNAJB9Q9UBS3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DNAJB9Q9UBS3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
DNAJB9Q9UBS3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DNAJB9Q9UBS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms