Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EXTL2Q9UBQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EXTL2Q9UBQ6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
EXTL2Q9UBQ6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EXTL2Q9UBQ6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EXTL2Q9UBQ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EXTL2Q9UBQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms