Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPASTQ9UBP0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPASTQ9UBP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SPASTQ9UBP0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SPASTQ9UBP0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPASTQ9UBP0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPASTQ9UBP0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms