Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATXN10Q9UBB4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATXN10Q9UBB4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATXN10Q9UBB4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ATXN10Q9UBB4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATXN10Q9UBB4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATXN10Q9UBB4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATXN10Q9UBB4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms