Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Wdr54Q9R0D8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Wdr54Q9R0D8 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Wdr54Q9R0D8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Wdr54Q9R0D8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Wdr54Q9R0D8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Wdr54Q9R0D8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Wdr54Q9R0D8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Wdr54Q9R0D8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms