Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atp11cQ9QZW0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atp11cQ9QZW0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atp11cQ9QZW0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Atp11cQ9QZW0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atp11cQ9QZW0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp11cQ9QZW0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp11cQ9QZW0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp11cQ9QZW0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms