Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS7

Nphs1, Nephrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphs1Q9QZS7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nphs1Q9QZS7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nphs1Q9QZS7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nphs1Q9QZS7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Nphs1Q9QZS7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nphs1Q9QZS7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphs1Q9QZS7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphs1Q9QZS7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 448.5 ms