Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Six6Q9QZ28 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Six6Q9QZ28 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Six6Q9QZ28 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Six6Q9QZ28 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Six6Q9QZ28 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Six6Q9QZ28 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms