Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Irx4Q9QY61 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Irx4Q9QY61 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Irx4Q9QY61 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Irx4Q9QY61 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Irx4Q9QY61 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Irx4Q9QY61 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Irx4Q9QY61 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms