Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cbx8Q9QXV1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cbx8Q9QXV1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cbx8Q9QXV1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cbx8Q9QXV1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cbx8Q9QXV1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cbx8Q9QXV1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cbx8Q9QXV1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms