Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trp53inp1Q9QXE4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trp53inp1Q9QXE4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trp53inp1Q9QXE4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trp53inp1Q9QXE4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Trp53inp1Q9QXE4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trp53inp1Q9QXE4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trp53inp1Q9QXE4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trp53inp1Q9QXE4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trp53inp1Q9QXE4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms