Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt17Q9QWL7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt17Q9QWL7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt17Q9QWL7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt17Q9QWL7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Krt17Q9QWL7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Krt17Q9QWL7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Krt17Q9QWL7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Krt17Q9QWL7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Krt17Q9QWL7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms