Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rai2Q9QVY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rai2Q9QVY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rai2Q9QVY8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rai2Q9QVY8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rai2Q9QVY8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rai2Q9QVY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rai2Q9QVY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms