Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2S2

NRXN2, Neurexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN2Q9P2S2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NRXN2Q9P2S2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NRXN2Q9P2S2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
NRXN2Q9P2S2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NRXN2Q9P2S2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NRXN2Q9P2S2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NRXN2Q9P2S2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NRXN2Q9P2S2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NRXN2Q9P2S2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NRXN2Q9P2S2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NRXN2Q9P2S2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NRXN2Q9P2S2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
NRXN2Q9P2S2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NRXN2Q9P2S2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms