Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2A4

ABI3, ABI gene family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABI3Q9P2A4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ABI3Q9P2A4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ABI3Q9P2A4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ABI3Q9P2A4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ABI3Q9P2A4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ABI3Q9P2A4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms