Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
VPS18Q9P253 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
VPS18Q9P253 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS18Q9P253 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
VPS18Q9P253 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
VPS18Q9P253 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS18Q9P253 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
VPS18Q9P253 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
VPS18Q9P253 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS18Q9P253 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
VPS18Q9P253 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS18Q9P253 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS18Q9P253 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS18Q9P253 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS18Q9P253 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
VPS18Q9P253 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS18Q9P253 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
VPS18Q9P253 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS18Q9P253 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
VPS18Q9P253 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS18Q9P253 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS18Q9P253 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS18Q9P253 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS18Q9P253 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS18Q9P253 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms