Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CNTN3Q9P232 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CNTN3Q9P232 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CNTN3Q9P232 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CNTN3Q9P232 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CNTN3Q9P232 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CNTN3Q9P232 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CNTN3Q9P232 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CNTN3Q9P232 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CNTN3Q9P232 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms