Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP1Q9P0J1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDP1Q9P0J1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDP1Q9P0J1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDP1Q9P0J1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PDP1Q9P0J1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PDP1Q9P0J1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDP1Q9P0J1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDP1Q9P0J1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms