Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN9

AIPL1, Aryl-hydrocarbon-interacting protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIPL1Q9NZN9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
AIPL1Q9NZN9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
AIPL1Q9NZN9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
AIPL1Q9NZN9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
AIPL1Q9NZN9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
AIPL1Q9NZN9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AIPL1Q9NZN9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AIPL1Q9NZN9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AIPL1Q9NZN9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AIPL1Q9NZN9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AIPL1Q9NZN9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms