Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNK4Q9NYG8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
KCNK4Q9NYG8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNK4Q9NYG8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNK4Q9NYG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KCNK4Q9NYG8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNK4Q9NYG8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms