Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLCO1C1Q9NYB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLCO1C1Q9NYB5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLCO1C1Q9NYB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLCO1C1Q9NYB5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLCO1C1Q9NYB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms