Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDIT4Q9NX09 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DDIT4Q9NX09 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDIT4Q9NX09 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDIT4Q9NX09 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDIT4Q9NX09 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDIT4Q9NX09 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
DDIT4Q9NX09 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms