Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATAD3AQ9NVI7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATAD3AQ9NVI7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATAD3AQ9NVI7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATAD3AQ9NVI7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATAD3AQ9NVI7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATAD3AQ9NVI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms