Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PARVAQ9NVD7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PARVAQ9NVD7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PARVAQ9NVD7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PARVAQ9NVD7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PARVAQ9NVD7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PARVAQ9NVD7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARVAQ9NVD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms