Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUS5

AP5S1, AP-5 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5S1Q9NUS5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
AP5S1Q9NUS5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
AP5S1Q9NUS5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
AP5S1Q9NUS5 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
AP5S1Q9NUS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
AP5S1Q9NUS5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
AP5S1Q9NUS5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
AP5S1Q9NUS5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP5S1Q9NUS5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
AP5S1Q9NUS5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP5S1Q9NUS5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
AP5S1Q9NUS5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms