Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UFSP2Q9NUQ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UFSP2Q9NUQ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UFSP2Q9NUQ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UFSP2Q9NUQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
UFSP2Q9NUQ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UFSP2Q9NUQ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms